记者11月5日从中国科学技术大学获悉,该校生物医学工程学院医学影像智能与机器人(MIRACLE)实验室周少华教授、熊鹏特任研究员团队发布一款开源RNA(核糖核酸)序列基础模型structRFM,当天凌晨,成果在线发表于国际学术期刊《自然》(Nature)。

一根链“怎么折”决定它能干什么

在生命体里,DNA是图纸,RNA是拿着图纸去干活的。它参与蛋白质合成、基因表达调控、RNA剪接等几乎每一项核心生命过程。

“形状决定功能。”熊鹏解释,RNA分子折成什么样,直接影响它的生物学活性,也影响它能不能和别的分子结合。所以,搞清楚序列、结构、功能三者之间的关系,既是揭示RNA生物学机制的基础,也是RNA药物设计的支撑。

难点在于,测序技术这些年积累了海量RNA序列数据,一条一条去做实验测结构,成本高、速度慢。近年来,借鉴自然语言处理中的预训练思路,让模型从海量序列里自己学规律,成为国际上的一条新赛道。但这类模型有个通病:它们读的是字母顺序,不懂字母之间的配对关系。

团队的做法,是把结构知识塞进预训练过程。

预训练完成后的structRFM,使用起来很省事,只输入序列,不用提供任何结构信息,模型就能提取出序列级、核苷酸级、核苷酸对级三个层次的特征,供下游任务调用。

发挥基础研究的作用

研究论文的两位通讯作者中,周少华是中国科大讲席教授、生物医学工程学院执行院长,也是MIRACLE实验室的创建者。熊鹏则是纯粹的结构计算出身,2021年曾参与创立一家生物科技公司并任CTO,2023年回到母校。两人在RNA这里碰了头。论文第一作者是中国科大生物医学工程学院博士朱河勤。

更值得留意的是“开源”二字。

目前,实验室已开放完整配对数据、模型权重和源代码。这意味着其他研究者不仅能复现结果,还能直接拿这套模型去改、去接不同的任务。

团队介绍,RNA正在成为药物研发的热点方向。mRNA疫苗、小核酸药物、靶向RNA的小分子,都依赖于对RNA序列与结构的准确理解。这项基础研究,将有望助力从分子模型到真正药物的推进,为今后更多原创药的研发提供技术支撑。

来源：安徽商报（2026年11月6日 2版）

记者：郜征

原文链接：https://ahsbszb.ahnews.com.cn/pc/con/202611/06/c1160500.html